Il secondo sottomarino Otsu-Gata Type B3 fu commissionato nel giugno 1944. LI-56 prese parte alla difesa delle isole Filippine e si impegnò nella battaglia del golfo di Leyte, durante la quale subì danni. Nel 1944, fu convertito in una portaerei siluri Kaiten. LI-56 andò perso nel corso della battaglia di Okinawa e le circostanze della sua perdita rimangono sconosciute.